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nnUnet 在windows 10 上使用

这里的安装教程和linux上的基本一样，可以参考nnUNet最舒服的训练教程（让我的奶奶也会用nnUNet（上）
这位大佬的教程，但是需要注意的有几点：

  1. 从github上pull下来的nnunet不能使用官方的地址，因为官方的开发者没有在win10上使用过nnunet，所以得换其他开发者改过的nnunet进行安装，链接如右win10 安装nnunet。
  2. 请在系统变量中添加
      export nnUNet_raw_data_base="/home/qiao/nnUNetFrame/DATASET/nnUNet_raw"
  export nnUNet_preprocessed="/home/qiao/nnUNetFrame/DATASET/nnUNet_preprocessed"
  export RESULTS_FOLDER="/home/qiao/nnUNetFrame/DATASET/nnUNet_trained_models"
    这几个路径。
    具体修改


    这三个变量。
  3. 路径拓扑结构：
  4. 下载预训练模型，测试框架是否适用：
    预训练模型下载地址,下载内容为一个压缩包：

    下载后把里面的所有内容解压到nnUNet_trained_models文件夹中，具体看第一张图的路径。
  5. 参考nnUNet最简单的推理教程（让我的奶奶也会用nnUNet（下），使用命令行进行推理：
    nnUNet_predict -i D:\nnUNet\DATASET\input\ -o D:\nnUNet\DATASET\output\ -t 6 -m 3d_fullres -f 4

总结

能够在win10上跑动预训练模型，已经给予我很大的安慰。

本文标签： nnUnetWindows

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